《ATLAS》是一款以海盜為題材的生存類沙盒遊戲，既然是海盜，那最離不開的就是海洋。雖說遊戲的陸地玩法豐富，但是更多的玩家還是喜歡駕駛船隻乘風破浪的感覺。目前遊戲中的大部分船隻都是需要玩家自己打造的，船隻的打造是一個極其複雜的過程，從挑選造船的地址，到擺放船塢，到搭建船身，再到為船隻打造零部件，整個過程或許需要花上好幾個星期。

這個過程雖然時間長，但是相當有趣，開發團隊在遊戲中引入了不少個性化的元素，讓玩家可以自由設計自己的船隻，所以在海盜世界，可以看見各種風格外觀的船隻，即使都是加利恩，也會有著截然不同的外觀。個性化元素的加入讓船隻的建造玩法獨具特色，在接下來的更新中，開發團隊進一步豐富了這類玩法，引入了船隻定製系統。

在這個系統引入之前，新版本中還會出現更多的船隻，在歷次更新的趨勢來看，新船隻的加入是必然，這些船隻或許可以直接購買，買來的時候是完全一樣的，但是利用船隻定製系統，玩家可以對其進行改裝，比如新增不同的零部件，零部件的數量不僅僅會影響船隻的外觀，還會影響整體的功能。

接下來會新引入一種零部件——欄杆，包括標準欄杆，加農炮欄杆，貨架欄杆，潛水附件欄杆和小艇機庫欄杆等等，這些欄杆可以為船隻增加不同的功能。除此之外新船隻和塗漆系統會逐漸相容，玩家可以為自己的船隻選擇合適顏色的油漆，打造出專屬於自己風格的船隻來。《ATLAS》船隻定製系統上線之後，海盜世界將會出現更多的特色船隻，也讓玩家感受到了高自由度的船隻玩法。