原發性血小板增多症的患者一般小於60歲，沒有心血管疾病等危險因素且沒有症狀的不用治療，只需要隨訪就可以了。此外，其他的病人需要治療。具體治療如下：

（1）對有已經有出血或血栓形成的患者要積極降低血小板可以改善症狀。

（2）患者有指、趾微血管缺血或腦血管缺血癥狀時，應積極進行降血小板治療。目標為降低巨核細胞增殖和血小板的生成。

（3）急性有危險的出血或血栓患者可用血細胞分離儀單採血小板術。此法降低血小板是短時的，其後會出現反跳，需與骨髓抑制劑協同使用。羥基脲系非烷化劑骨髓抑制劑，對本病有很好的療效。羥基脲可引起快速骨髓抑制，開始7天內應檢查血細胞計數並在以後監控。維持劑量需個體化，根據血細胞計數調整用藥劑量。約80%患者在8周內可使血小板降至50010/L以下，並可長期控制血小板數。

（4）氯咪喹酮：對降低血小板計數非常有效，是一線治療藥物之一。它能透過抑制骨髓巨核細胞成熟而降低血小板。約11天可降低一半血小板計數。患者服藥期間血小板計數可以控制得很好，但停藥後大多數患者血小板計數迅速上升。副作用有神經和消化道症狀、心悸及體液瀦留。

（5）重組-干擾素：為治療本病的有效藥物，可抑制異常巨核細胞克隆的分化，降低巨核細胞的大小和倍增。大多數患者用干擾素治療1個月，血小板計數可降至正常或接近正常範圍。開始劑量皮下注射干擾素每日300萬單位，血小板接近正常後根據個體的治療反應和耐受性調整劑量，以後可用較小劑量每週3次皮下注射維持多年。停止使用後血小板可增多、復發。主要為流感樣副作用，可有發熱、關節肌肉痠痛等，減少劑量或解熱止痛藥可減輕或緩解。干擾素治療可伴有白細胞計數下降。

（6）阿司匹林：為有效的輔助治療藥物，對指、趾缺血和腦血管缺血癥狀特別有效。缺點是在有些患者可引起嚴重出血，使出血時間顯著延長，因而使用時需慎重。