作為清朝執掌地方軍政大權的封疆大吏，總督、巡撫地位極高。這兩個職位繼承自明朝，又根據現實情況，進行許多變動。四川地區的總督、巡撫，就是如此。而最大的變化，就是在乾隆十三年時，由四川總督兼任四川巡撫的職務，四川巡撫被裁撤。

這個變動，其實並非乾隆拍腦門的決定，而是長期以來，四川的歷史變化。四川位處西南腹地，是內地重要樞紐，省內物產豐饒，有大片適合耕種的土地，以及發達的水利工程。

千年以前，四川就有成都這樣可以在繁華上，媲美洛陽、揚州的城市。這樣一個省份，自然不能要牢牢把握在手中。

可是，順治年間，清朝雖然入關佔領北京，可是四川仍在張獻忠手裡。張獻忠在明末農民戰爭中崛起，麾下有一支經歷戰爭磨練的軍隊，實力不弱。一開始時，清朝曾主動招降張獻忠，但被拒絕。

不過，直到順治二年，清朝擊敗李自成主力後，才開始把打擊目標放在張獻忠身上。當時除了軍事上的安排，其中一個變化，就是增設總督，管轄湖廣、四川。

跟巡撫不同，總督更偏向軍事，可以更好協調軍事，集中軍事資源。順治四年時，才第一次設立專門的四川總督。此時的四川總督，仍是虛銜，並沒有真正的轄區。

順治五年設立的四川巡撫，其實也沒有真正的轄區。但是，已經可以看出，清朝有足夠餘力，開始完善對四川的地方管轄。設立四川巡撫時，清朝對四川已經有一定戰績。

順治四年時，清朝打死張獻忠，並趁機佔領四川。只是很快遭到反撲，並沒有長久在當地紮根。形勢仍在不斷變化，四川總督的職位，也在順治年間，經歷多次變化。

從順治到雍正時期，四川總督還經常被併入陝西、湖廣。這都是根據戰事需要，進行調整。比如順治年間讓陝西總督兼任四川，就是因為四川當時缺少糧草，需要從陝西調集。

隨著天下逐漸平定，清朝完全佔領陝西后，四川總督、四川巡撫也有自己專門的轄區。

這種分開設立，也是考慮到當時的具體情況。總督偏向軍事，巡撫注重民事。這種分開設立，其實是很有必要的。清朝初年，面臨各種軍事戰爭，突發情況。即便順治時期，天下基本平定。

可是，到康熙時期，吳三桂舉起“反清復明”的旗幟後，很多地方都有人起來相應。除了老百姓，還有不少是總督、總兵這種級別的官員。設立總督坐鎮，應對突發軍事戰爭，就是必然的。

另一方面，四川自明末數十年戰爭後，人口凋敝，土地荒蕪。很多地方甚至出現虎患，大白天的時候，也可以看到老虎在路上四處閒逛。縣衙、學府，都成為老虎住的地方。即便是白天7、8個人拿著棍子一起走，都有可能被老虎叼走。

歐陽直在《蜀亂》裡說到：‘’四川遍地皆虎，或七八或一二十，升樓上屋，浮水渡船。”當地又京城爆發瘟疫，很多人得不到醫治，只能躺在床上等死。這些情況，又導致糧食奇缺。軍隊沒有軍糧，就劫掠百姓。清朝初年的四川，幾乎沒有生氣，斷了人煙。

讓四川巡撫專門處理民事，對於四川的恢復，極為有利。後來對四川影響極大的“湖廣填四川”政策，便是由康熙時期的四川巡撫張德地提出的。而且，巡撫又可以協助朝廷調集軍糧，對於清朝初年複雜的軍事變化，也極為有利。

但是，在康熙時期，就已經有讓四川總督兼任四川巡撫的例子。康熙五十七年的時候，朝廷覺得年羹堯辦事不錯。就讓他以四川總督的身份，兼任四川巡撫。

這種安排，有它的好處。四川距離京城，路途遙遠。授予總督更大的許可權，對於處理地方事務，極為有利。不過，此時仍只是人事上的安排，而非固定的制度。

到後來，清朝開始推行讓總督兼任駐地省份巡撫的慣例。如閩浙總督駐地福州，它就會兼任福建巡撫的位置。四川總督本來就只管四川一個省份，讓它兼任四川巡撫，也是跟其他省份相同。

當然，擴大總督的許可權，也有它的危險。這容易讓總督割據地方，不聽調遣。所以，除了各種監察官員，乾隆十三年時，朝廷又把四川總督定為專缺。專缺的含義在於，這些特定職位，必須由特定出身的官員擔任。這些出身可以分為宗室、滿洲八旗人員、蒙古八旗人員、漢軍八旗人員、內務府人員和漢人。

這套做法，可以讓皇帝把職位交到自己更信任的官員手中。乾隆十四年，朝廷讓四川總督正式兼任四川巡撫，並裁撤四川巡撫職位。

後來又讓四川總督兼任都察院右都御史和兵部尚書的職位。歸根到底，這些職位無論是轄區或職權上的任何調整變化，都是為了方便朝廷進行更好的管理和統治。

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