關於晚清大太監李蓮英的死因，無論是正史還是野史，都語焉不詳，“病故”、“及死去”是常見的字眼。1908年，李蓮英在操持完慈禧太后和光緒皇帝兩人葬禮，守孝百日後出宮養老。

李蓮英離開紫禁城後，搬到了北京棉花衚衕家中，過著吃齋唸佛閉門謝客的生活。僅過了3年，即1911年，李蓮英去世。據李蓮英家族後人表示，李蓮英是病死，死因是痢疾不治，患病後三四天就去世了。

剛開始，大家對上面這種說法比較認可，可在李蓮英去世55年後，關於他的死因又起了波瀾。事情的起因是1966年夏天，人們挖開了李蓮英的墓地。當大家進入墓室，令人後背發涼的一幕出現了，人們在棺材裡發現了李蓮英的一顆骷髏頭，沒有看到軀體。

只有頭骨，沒有軀幹，這意味著李蓮英很可能不是病死了。李蓮英究竟怎麼死的？綜合各種說法，“他殺”成為大家比較認可的說法。這有引發了一個問題，如果李蓮英是被人殺害的，那究竟是誰殺的？有三種說法。

說法一、被革命黨人殺害。持這種說法的人認為，李蓮英支援慈禧太后，甚至是他殺手毒死了光緒皇帝，他還慫恿慈禧太后鎮壓革命黨人，他得罪了太多的人，結果被殺。

說法二、袁世凱的親信江朝宗殺機殺掉李蓮英。說是當時擔任九門提督的江朝宗請李蓮英吃飯，然後派人在李蓮英回家路過北海時，將其殺害。但是這種說法有個難以解釋的問題，1910年的江朝宗還在陝西漢中鎮總兵任上，他是直到1912年才調回北京。這就意味著江朝宗怎麼可能請李蓮英吃飯？

說法三、李蓮英的侄孫女的口述，李蓮英是在討債的途中被殺的。據說，李蓮英曾去山東探望自己的侄孫女，順便討債。誰曾想，當李蓮英到了山東和河北交界時，被人殺死。隨從們嚇得魂飛魄散，只把李蓮英的頭顱用包袱裝回北京。

儘管李蓮英死因成謎，但他死後還是得到了厚葬。不過，李蓮英墓地被人們挖開，拿到了那顆頭顱之後，曾被學生們當足球來踢，後被扔在了學校廁所的糞坑裡。至於李蓮英的頭顱最後下落，就無人知曉了。