貫穿《玉樓春》的主線故事就是林府滅門慘案，林少春作為唯一的倖存者活著的希望就是報殺父之仇，她與真兇不共戴天。

奇怪的是林府的冤案第9集就破案了，順利的不像一樁懸案，可事實上一些小官員早就覺得不對勁了，管糧倉大門的孫遜竟未牽扯其中，恐怕有更大的陰謀，皇上處理案件的時候也以一種奇怪的態度面對，彷彿不太想查清一樣。

終於在接近大結局的時候故事明朗了，孫遜才是害林府的真兇，這是他和皇上的陰謀，所以孫府才會越來越輝煌，孫有貞才能成為寵妃。

但伴君如伴虎，孫府權勢滔天已經令皇上忌憚了，這一次皇上又聯合了賈逢源和他的世伯，孫府岌岌可危。

要想抓住孫遜的把柄，林少春是關鍵，可得知真相之後崩潰了，她已經成為孫家婦喊孫遜父親，認賊作父的感覺還有和孫玉樓的關係將她壓垮了，無法面對真相，兩人在書房裡唱了一曲剛認識時的戲，趁著孫玉樓醉了，林少春跳了河。

《玉樓春》片尾曲裡林少春跳河漸漸沉入水底，孫玉樓連忙跳河來救，面對如此場面男主太勇了，寫了一份休書就上朝大義滅親。

林少春醒來看到桌子上的休書哭到崩潰，一邊是心愛的人一邊是親人，手心手背都是肉，她不知道該怎麼辦。

孫玉樓作為一個清官，一個有良心的人毅然決然大義滅親，保住了孫府其他人的性命，自此與林少春死生不復相見。

一切塵埃落定之後，林少春才感覺出孫玉樓的深情，感受到他的無私付出，瞬間覺悟不應該把上一輩人的仇恨強加在彼此身上，她不接受休書，梳著夫人頭找到了在街邊演皮影的玉樓，兩人和好如初，做一對普普通通的平頭百姓。

《玉樓春》裡的另外幾對夫婦大結局都很好，只有孫世傑與吳月紅再沒緣分了，自從桃夭懷孕歸來成功入了孫府，他與月紅之間的感情線就斷了，一個女人再愛一個男人，也不會一而再再而三的原諒他的背叛，兩人當初在寺廟裡掛著的紅緞被風颳了下來，代表姻緣線已斷，桃夭下獄那天就是孫世傑了斷之日。