據專家介紹，中央空調系統不及時清洗，不但空氣置換效果變差，積塵容易誘發細菌滋生，風道也會成為寄生物和昆蟲的搖籃。雖然如此，並未引起廠商及使用者的足夠重視，行業清洗現狀不容樂觀。有業內人士透露，中央空調的衛生合格率很低，真正清洗過的不足1%。一方面是因為中央空調的清洗費用太高，通常是每平方米 30元到40元不等，這就意味著給中央空調清洗一次要花費十幾萬到幾十萬元，一般單位沒有這項成本預算，而作為生產廠家也很少主動上門“清掃”；另一方面，中央空調清洗還沒有相對完善的配套產業形成。

另外：

1、空氣置換效果較差：在使用中央空調環境下，大多數均為封閉、半封閉空間，室內空氣屬迴圈利用，空氣的清潔度依靠空調本身的過濾和定時輸送活量新風來維持，因此相對室外空氣來講新鮮度較為渾濁。

2、積塵誘了細菌滋生：由於中央空調是依靠風道及出風口將處理後的空氣送入房間，風道屬密閉空間，而室外空氣中各類懸浮顆粒物不能完全被空調過濾裝置所阻隔，因此微細灰塵便進入風道黏附在風道內壁上，加之大多數風道狹小，日積月累便形成大量積塵。由於積塵極易滋生各類有害微生物，如：病毒、細菌、內黴素、真菌、軍團菌、冠狀病毒等。

3、寄生物和昆蟲的搖籃：由於風道佈置大多處於樓宇吊頂板內，加之風道內四季溫溼度較為適宜，因此常常成為寄生動物和昆蟲的活動空間，（如：老鼠、蟑螂等）。據上海報道，上海某大廈清掃中央空調風道一共清掃出兩噸垃圾，其中有大量的老鼠昆蟲屍體。