秦始皇燒燬前朝書籍，活埋幾百“儒士”，留下“毀古書”、“濫殺人”的壞形象。秦滅六國，理論上當時中國6/7的人恨他，細思密恐。太史公怎麼說的呢？《史記》載“所不去者，醫藥卜筮種樹之書……”。太史公說“醫藥、占卜、農牧”等，實用、技術和農耕書籍並沒毀（諸子書籍也有保留）。可見，秦始皇有針對性。

按李斯的意思，每個朝代的具體情況是不一樣的，現在有現在的情況，陛下你創下亙古未有的基業，你的偉大，又怎是這些讀書人知道的呢？現在國家已經統一，最重要的是老百姓要吃飽飯，至於讀書嘛，不僅沒什麼用，還容易惹出事端。“史官非秦記皆燒之。”對於史書一刀切，除了秦國的史書，其他國家的全部燒掉。

除開了“車同軌”之外又一個重要的制度就是“書同文”。秦始皇希望能讓“書同文”在帝國獲得最廣泛的文化認同，但當時還有一件事讓秦始皇頗為頭疼：思想上的統一。畢竟春秋戰國是一個百家爭鳴的時代，這種思想上的百花齊放在分裂的局勢下是沒有問題的，每一個諸侯國都可以有自己的信仰，但是秦朝大一統之後，在思想上肯定不可能像之前那麼自由，肯定是要收緊的。

這是代表新興地主階級對奴隸主貴族復辟活動採取的一個必要的專政手段。而後世對他的評價是罪大惡極。當時站在他的角度上司正確的，必須用強制的手段才能達到目的，一旦他的做法和當時社會主流思想相悖時，文人就會用筆桿子用來報仇，所以他的罵名累累。