鹽課在古代社會一直是財稅收入的重要來源，同時也是民間走私最厲害的地方。眼見李衛在處理鹽政上有獨到心得，雍正三年李衛調任浙江巡撫，主管兩浙鹽政，當時兩浙地區鹽梟盛行，組織強大。李衛大力打擊私鹽販子，設官兵巡緝查私，督飭將吏水陸巡查，打擊鹽梟整頓鹽政。對參與私鹽買賣的豪強地主及達官貴人，也絕不留情。這項工作也做得讓雍正帝十分滿意。

彼時江浙地區的社會秩序混亂，盜匪頻頻出沒，李衛經走訪發現之所以當地多盜賊，是因為人多地少，以致無業農民只能以偷盜為生，為此他招募百姓墾田曬鹽，減少失業農民的數量，又興修水利，灌溉農田，江浙地區在他的治理下，一改此前的積弊，以致“千里無盜賊”。雍正為此多次下發批示讓各省官吏學習：“督撫中能察究匪類，惟李衛為第一，爾當仿效之。”。

雍正在總結李衛的工作成績時，不吝讚美：“乃成全聖祖之是也，豈止朕之功臣，乃朕之恩人也。”竟視其為恩人，提升李衛為兩江總督兼管浙江。兩江總督本來就管理了江蘇、安徽、江西三省，加上浙江，也就是說東南4個省都在李衛的控制之下，這都是大清朝最重要的財賦來源之地，全國最富庶的地區，說是掌控王朝經濟命運也不為過。要知道李衛可是漢人，可見在雍正眼裡他有多重要。

雍正七年，李衛封兵部尚書，加太子少傅，後又升任直隸總督，命提督以下並受節制。終雍正帝一朝，李衛官運亨通，風生水起，不過這也和雍正帝“取才”的用人方式有關。李衛雖然政績卓著，但卻恃才傲物，不懂圓滑為官之道，甚至仗著雍正帝對他的寵幸，不將上司放在眼裡，和同僚間的關係也不好，屢屢被參。為此雍正帝多次告誡他“時戒血氣，少務和平”。

李衛可犯了難，既要剛直不阿，又要有涵養、做個全人，誰能做到？乾脆來了個“置若罔聞”，該咋樣還是咋樣。但是這個脾氣到了乾隆時期就吃不開了，乾隆是個小心眼，吃軟不吃硬，上臺以後，他也有自己的心腹集團，並不喜歡李衛，但因其能秉公執法，特賜“四團龍補服”。後來李衛漸漸失寵，乾隆收回了很多雍正帝當初的賞賜，不過並沒有為難他。

乾隆三年，李衛因病去世，年五十一歲，乾隆以總督的規格厚葬了他，並賜諡號“敏達”，入京師賢良祠，其五子皆在朝為官。後來不知為何，乾隆突然非常厭惡地評價李衛：“於督撫中並非公正純臣，在浙江無功德於民，聞其仰借皇考恩眷，頗多任性驕縱之處。設使此時尚在，猶當究治其愆！”如李衛地下有知，估計要慶幸自己死的早！