在太平天國的全盛時期，太平軍隊佔領了南京， 當入侵南京時，太平軍隊在人數和火力上都有相當大的優勢，尤其是太平軍隊的新式火炮，而太平的軍隊基本上毫無懸念地把它拿下了。漢軍與之作戰時，戰鬥力不太好。相反，這是一支只有20000人的旗人軍隊。他們幾次給太平軍隊造成了很大的打擊和損失。這主要是因為這些旗手都知道，如果他們落入太平天國的手中，就不可能生存。

當太平軍隊進攻滿城時，所有的旗人們士氣高昂，所有的老人和孩子都出來歡呼助威。旗人甚至婦女都拿起武器，在城牆上與太平軍隊作戰，戰鬥的激烈程度一度升溫。楊秀清連續發動了三次猛烈的攻擊，都被勇敢而無與倫比的旗人擊敗了。經過幾次戰鬥，數千人在太平軍隊中喪生，屍體堆積如山。然而，對南京來說，太平王國決心要贏。無論旗人採取什麼樣的反擊，楊秀清都必須拿走南京最難啃的骨頭。最後，在分析了戰場之後，楊秀清決定用輪戰來對付剩下的人。

就這樣，太平軍隊輪流與旗手作戰，而旗手在越南的戰鬥越來越少，所以旗俊被太平軍隊殺死。就這樣，在付出數萬人的慘痛代價後，太平天國最終全面佔領了南京。

佔領南京後，太平天國也達到了權力的頂峰。後來天王和國王們開始定居入駐，南京被重新命名為天京。清朝在失去南京之後，作為太平天國的首都，清朝開始動員更多的力量來對抗太平王國。清朝建立了北大營和南大營，這樣一左一右威脅太平天國的安危。