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從6分細胞焦亡+ceRNA文獻中get SCI前言和方法部分撰寫細節

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從6分細胞焦亡+ceRNA文獻中get SCI前言和方法部分撰寫細節

細胞焦亡雖說是近幾年的研究熱點,但現在想蹭熱點已經不是那麼容易啦,單純只做個焦亡有可能已經不能抓住審稿人的眼球啦,那就需要其他的聯合起來進行分析~

小薇今天給大家分享一篇

細胞焦亡和ceRNA

聯合分析的文章,這篇文章是2021年發表在International Journal of Oncology雜誌上,影響因子是5。88,題目是“Long noncoding RNA nuclear paraspeckle assembly transcript 1 regulates ionizing radiationinduced pyroptosis via microRNA448/gasdermin E in colorectal cancer cells ”,

從投稿到接收僅倆月

,快一起來看看吧~

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思維導圖

小薇在這裡按照自己的理解對文獻做了個簡單的思維導圖,便於大家快速理解文章的分析思路哈~ 另外,不懂

思維導圖、流程圖,也可以私信小編哦~

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摘要

這篇文章摘要分為

一段式

,在背景部分先介紹了焦亡和lncRNA,然後說焦亡在癌症放療方面的作用和潛在機制還不清楚,後面很自然引出本研究的目的。接著是本研究所用到的方法和得到的結論,最後說明本研究的研究意義。摘要看起來是比較完整的,後續大家在寫文章的時候可以借鑑,

不過有些期刊要求摘要分為四段式,所以需要注意加上小標題,注意格式~

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前言

第一段:

主要介紹焦亡,焦亡執行蛋白GSDME以及誘發焦亡的機制。

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第二段:

介紹放療對於很多實體瘤的作用,包括結直腸癌。然後說明放療會透過很多通路調控凋亡等。最後說明在很多腫瘤,特別是在結直腸癌中,放療對焦亡的作用及其潛在的分子機制尚不清楚。

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第三、四段:

第三段主要介紹lncRNA,說明lncRNA在很多癌症和細胞中在輻射敏感性方面有重要作用,特別是在結直腸癌中輻射誘發的DNA損傷。第四段主要引用文獻說明了lncRNA會調控焦亡的媒介,但是lncRNA對焦亡執行蛋白GSDM的作用仍未被研究。小薇認為在這裡第三段和第四段可以整合成一段,有和小薇意見一致的小夥伴嘛?

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最後一段:

主要對文章的研究目的以及研究意義進行了說明。

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方法

(1)細胞培養和電離輻射處理:

這裡所用到的細胞系是239T細胞以及結直腸癌HCT116細胞,還對細胞電離輻射的細節進行了說明。

一般涉及到細胞部分的內容,方法部分需要交代清楚本研究用到了哪些細胞系、細胞系的來源;細胞培養所用到的培養基、培養溫度等細節(細胞系不同,所用培養基、培養溫度等細節就不同,所以需重點描述);還有試劑廠家等也需要標註。

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(2)質粒、miRNA mimics、siRNAs及轉染:

這裡構建了3個過表達載體(miR-375、miR-379、miR-448 mimics),還有GSDME和NEAT1沉默載體(siGSDME和siNEAT1)。在這部分寫作的時候,

需提到質粒、miRNA過表達、RNA沉默的處理細節,交代清楚所用的序列、陰性對照、載體合成公司等。轉染部分需描述清楚轉染細胞系、生長密度、所轉染的載體、所用試劑來源、檢測轉染效率方法(PCR、WB)等。

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(3)熒光素酶報告分析:

這裡主要用於分析GSDME的轉錄活性,用於分析GSDME和miR-448的靶向結合。這部分寫作時候需寫清楚載體的生成、細胞的密度和處理方法,所用到的試劑盒以及熒光素酶活性計算方法。

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(4)細胞活性檢測、焦亡細胞觀察、LDH檢測以及流式:

這部分主要目的是為了確定細胞發生了焦亡,需注意說明檢測的細胞系、分組、時間點。另外,觀察焦亡細胞需提及觀察所用的顯微鏡及在多少個視野下進行觀察的;LDH檢測需要註明計算公式;流式需註明流式檢測死亡細胞所用的試劑盒以及其貨號、廠家以及最後得到資料的處理軟體。

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(5)RT-PCR和WB:

這兩部分大家應該不會陌生啦,一般基礎類的文章中幾乎都有這兩部分。PCR這裡需註明總RNA提取(一般還需對提取的RNA進行質量檢測,這裡沒有提及)、cDNA反轉錄、PCR擴增所用的方法及試劑,並且PCR所用的引物也需要提及並在文章中進行展示;PCR反應的條件(有的詳細的文章也會對PCR反應體系進行說明,這裡沒有提及)和所使用的內參也需要註明。WB部分這裡首先需提及蛋白提取的方法、蛋白濃度檢測方法;SDS-PAGE以及轉膜實驗操作;孵育一抗二抗是WB實驗的關鍵,所以這裡必須交代清楚所用一抗和二抗是什麼,以及其貨號和廠家,還有一抗二抗所用濃度,孵育過程的時間和溫度,以及所用的封閉液是什麼;最後說明結果檢測方法/試劑盒和所使用儀器以及內參。

從6分細胞焦亡+ceRNA文獻中get SCI前言和方法部分撰寫細節

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(6)統計分析部分:

這部分需說清楚每部分作用的統計分析方法,最後一句說明P<0。05表示顯著性差異。

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怎麼樣,這樣的研究思路和寫作中借鑑和需要注意的地方你們學會啦嘛?

焦亡聯合ceRNA

,換個腫瘤也可以進行復刻哈~ 感興趣的小夥伴可以下載文獻去看看文獻的具體分析結果,具體瞭解一下。另外,還有問題的小夥伴可以給我們留言哈~

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