慈禧太后去世後，李蓮英失了靠山，再也沒有了往日的威風。取而代之的是裕隆太后的寵愛太監-小德張。不幾天，李蓮英就被趕出宮去，不過裕隆太后對他還不錯，讓他“原品致休”。
李蓮英富貴一生，在北京就有多處房產。他退休後住在南花園一塊僻靜房產處養老。他雖然沒有親生兒女，卻有4個乾兒子（這四個兒子都是他親兄弟的兒子），以及一些侄兒侄女，他們陪伴身邊，頗不寂寞，至少比許多太監臨終時無依無靠強多了。
失去權柄後，李蓮英迅速衰老，整日無精打采，眼窩深陷，誰也看不出這就是當年那個威風八面的大總管。離開禁宮第二年（1910），62歲的李蓮英步履蹣跚，語言遲鈍，已呈現出距死神不遠的種種先兆。李蓮英的嗣子和侄子們開始考慮他的後事了。
宣統三年（1911年），也就是在李蓮英出宮剛兩年，在寂寞中病入膏盲，已屬不治之症，久臥病榻的李蓮英瘦得皮包骨，氣數將盡，日暮西山。死到臨頭，他把嗣子、侄兒們召集到一起起交待後事。他首先向他的晚輩們痛哭流涕地講述了自己9歲被閽，人宮當差，而後得到慈禧太后恩寬，一步步爬上大總管職位的經歷，並且為李家“置”下了豐厚的家產家業，告訴後輩們要謹慎持家，防止財源枯竭。他還交待後輩，在他死後不要盲目行事，他的喪事一切都要奏明朝廷，請隆裕太后恩准定奪。最後，李蓮英讓李成武把他手中的銀兩分給幾個嗣子侄兒。據說，他的4個繼子各得白銀40萬兩，另有一大口袋珠寶，其他各位侄兒分得白銀20萬兩，他的兩個繼女分得17萬兩。此外，李蓮英在宮中存有30多萬兩白銀和兩箱珠寶。但這些東西沒辦法拿出來了，只好捨棄。當然，這些財富也只是他所聚斂財富的一部分，而且還不包括數額巨大、價值萬貫的幾處房產。
除了房地產等財富外，李蓮英留給後輩的財富與他的財富總額也是有差距的。原因在哪裡呢？原來，李蓮英卸去總管職務離開清宮之後，許多人垂涎他的財富，不僅有小德張之類的官宦，還有他的一些親戚和那幾位繼子。這些人出入李連英的幾處住宅，無一不是為了他的財富。此外，更有一些不明身分的理髮匠、剃頭匠、修鍋補鞋匠等人，經常不經允許，強行人入李蓮英的住宅，東張西望。這些人實際上是小德張等人派出的親信爪牙，到這裡探聽虛實。還因為小德張假借新主子隆裕太后的淫威，想要抄沒他的財產，他被迫將財產轉移別處，財產被很快分散。除了他的4個繼子之外，他的孫子、孫媳婦、侄子、侄女、侄媳等各方親威，整天吵鬧於李家及李蓮英的養老處，其目的只有一個，就是為了瓜分他的財產。
財產分割完畢後，一波未平又生風波。李蓮英在為繼子分銀過程中，只分了埋在住宅和外院兩處宅第地下的一些銀子，存入銀號的銀子絲毫未動。誰知4個繼子見財眼紅，挖出的銀子、珠寶很快被4個如狼似虎的繼子搶空。李連英見此法不靈，想改用銀票支付的辦法分配財富，但4個繼子根本不聽，四處挖據，只要見到銀子就一哄而上，甚至發生生口角和撕打，李蓮英見狀傷心萬分。然而，這一切都是他留下的禍患，想制止或扭轉已經不可能了。
在他的繼子、任孫、親友為他的財富爭執不休之際，李蓮英的生命也已接近尾聲，病情日益加重，即使不是醫生，不懂醫道的人也能看出：李蓮英不久於人世了。李成武見狀奏請隆裕太后，獲得恩准後，輪流進入南花園守護李蓮英。李成武等人費盡心思，想盡辦法，百般治理，也未能挽救這個曾經權傾朝野的大太監的性命。李蓮英於宣統三年（1911年）二月初四死去。
李蓮英死後，他的兄弟子嗣們按照他生前的交待，沒有馬上發喪。李成武等人給朝廷寫了一道奏章，請求隆裕太后降旨，給李蓮英發喪。二月初六，隆裕太后降旨，按祖祖宗家法，李連英屬六品以上太監，賜塋地一塊，在恩濟莊大公地內安葬，並易以祭壇和治銀1000兩。李家接旨後，馬上準備發喪的各項安排及日期。李家又奏請隆裕太后，請求按國家元勳級別來給李蓮英發喪。並聲稱，國庫吃緊，費用由李家自已承擔。隆裕太后批准了李家的請求，一個靠玩弄權術起家的太監，死後竟能享有國家元勳的“待遇”。李家人為了擴大影響，在京城內外散發喪報，李蓮英一些生前好友，以及那些得到過李蓮英好處的人紛紛前來弔唁，或送來祭銀祭品，朝內一些文臣武將也前來弔唁。
李家對李蓮英的喪事盡其鋪張之能事，在一個月的弔唁活動中，去掉白銀數萬兩。但此時的李家也差不多和李蓮英一樣盡了氣數，否則幾十萬、幾百萬也不止。
恩濟莊的太監塋地裡，自明朝以來埋葬的首領太監以上“級別”的太監300餘人，但誰的墳墓也不如李蓮英墓地那麼氣派，彷彿在向世人證實，這位太監大總管到了陰曹地府之後，也是死去的太監們的總管。李蓮英的基地在恩濟莊的太監塋地中形成了個獨立的院落，前有石橋和牌坊，牌坊的橫眉上寫著“欽賜李大總管之墓”。全部陽宅共四五十間，供李家人來掃墓時休息之用。恩濟莊內有座關帝廟，關帝廟東側建有李蓮英的一座桐堂，桐堂掛有李蓮英的一幅畫像。在家人來掃墓時，便把這張畫像展開，平時則捲起來。
李蓮英的墳基連同地面建築佔地至少在10畝以上。墓前的石牌坊、供桌均仿清陵樣式製做的，只不過尺寸小了一些。 李家人為李蓮英立了一塊高3。5米，寬1米多的漢白玉石碑。在整個清代的幾百年間，太監死後立這樣的燕碑也是空前絕後的。一般的總管、首領太監死後，所立石碑多數是青砂石的僅有李蓮英一個的墓碑是用漢白玉製成的，漢白玉墓碑上刻有“永垂不朽”四個大字。